増殖速度の測定

 

私たちは、マイクロプレートリーダーで取得したデータから最大増殖速度を以下のように算出します。基本的には、時系列データの対数をとって傾きが最大となるところを最大増殖速度としますが、これを自動でやろうとすると測定ノイズが邪魔になるので、以下の操作を行っています。

  1. 時系列データの9区間を移動しながら、片対数の直線近似をおこない、その区間の増殖速度を算出する。
  2. この近似に対するR二乗値を計算する。R二乗値がある一定以上の区間のデータを採用する。これによりノイズが少なくなめらかに増加している区間のデータを選びだす。
  3. 2で選ばれた区間の増殖速度の最大値を抽出し、最大増殖速度とする

実際には、上記の計算はエクセルのワークシートで自動で行います。必要な方は以下のリンクからダウンロードして下さい。

最大増殖速度算定用ワークシート

 

2013-09-30 (月) 13:35:14