[[増殖速度の測定]]

私たちは、マイクロプレートリーダーで取得したデータから最大増殖速度を以下の方法で算出しています。

基本的には対数をとって、傾きが最大となるところを最大増殖速度とするのですが、問題となるのは測定時のノイズで、ノイズがのると誤った値を最大増殖速度にしてしまうことがあります。これを排除するために私たちは以下の様な操作を行っています。

1)OD959の時系列データの9区間を移動しながら、片対数の直線近似をおこなう(これがその区間の増殖速度になる)。この近似に対してR二乗値を計算しノイズを評価する。R二乗値がある一定以上(例えば0.9など)のデータを採用し、ノイズが少なくなめらかに増加している区間のデータを選び出す。

2)1で選ばれたなめらかな区間における増殖速度の最大値を抽出する(これが最大増殖速度となる)。

実際には、エクセルのワークシートで上記が自動計算できるようにしてあります。


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