遺伝子つなひき法
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*遺伝子つなひき法 [#sd06ae47]
遺伝子つなひき法は、英語ではgenetic Tug-Of-Warといってお...
~
日本語の解説は以下を参照してください。
-守屋央朗「細胞システムのロバストネスの測定」[[「現代化学...
-守屋央朗「頑健さを支えるしなやかさを計測する」 [[生命誌5...
-守屋央朗 北野宏明「gTOW法によるロバストネスの測定」 実験...
~
英語での専門的な解説は以下の論文を参照してください。
-&ref_paper(22722869);
#br
----
#br
実験の手順を簡単に説明します。
+pTOWというプラスミド((出芽酵母で用いるプラスミドベクター...
+その細胞内でのコピー数を上限(細胞が死ぬ直前)まで上げ、
+その数を測る。
この中で2番がこの実験系の特徴ですが、それについては以下の...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#br
限界を知りたい標的の遺伝子をクローンしたプラスミド(pTOW-...
-このプラスミドの第1の特徴は細胞の中でマルチコピーになり...
次にこの細胞集団をロイシンのない培地に移してやります(''...
-正確に言うとプラスミド上の'''leu2d'''遺伝子の活性が非常...
この状態では当然標的の遺伝子のコピー数も上昇し、それにと...
もしここで目的遺伝子の機能を知りたいのであれば、「細胞が...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#br
しかしここでの目的は「遺伝子コピー数をどこまであげられる...
それはどうやって決められるのでしょうか?
実はこの2次選択の段階でおきている現象(遺伝子つなひき)に...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#br
上図はその概念図です。
+'''leu2d'''のコピー数が高いほど細胞の増殖は早い、つまり'...
+一方で、同じプラスミドDNA上の標的の遺伝子に上限がある(...
+これら2つの引っ張り合いがうまく釣り合ったところのコピー...
この実験では、マイクロプレートリーダで細胞の[[増殖速度の...
かなりややこしい遺伝学を使っていて、わかりにくいかもしれ...
すべての実験手法が完璧ではないように、この実験手法にもい...
#br
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#br
以下はgTOWの英語での説明
For a given gene, its ORF and promoter regulatory element...
There will be a tendency for cells to acquire more and mo...
#br
[[成果発表/論文発表]]のページへ~
[[トップページ]]へ~
[[システムバイオロジー]]のページへ
RIGHT:&lastmod();
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*遺伝子つなひき法 [#sd06ae47]
遺伝子つなひき法は、英語ではgenetic Tug-Of-Warといってお...
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日本語の解説は以下を参照してください。
-守屋央朗「細胞システムのロバストネスの測定」[[「現代化学...
-守屋央朗「頑健さを支えるしなやかさを計測する」 [[生命誌5...
-守屋央朗 北野宏明「gTOW法によるロバストネスの測定」 実験...
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英語での専門的な解説は以下の論文を参照してください。
-&ref_paper(22722869);
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実験の手順を簡単に説明します。
+pTOWというプラスミド((出芽酵母で用いるプラスミドベクター...
+その細胞内でのコピー数を上限(細胞が死ぬ直前)まで上げ、
+その数を測る。
この中で2番がこの実験系の特徴ですが、それについては以下の...
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#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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限界を知りたい標的の遺伝子をクローンしたプラスミド(pTOW-...
-このプラスミドの第1の特徴は細胞の中でマルチコピーになり...
次にこの細胞集団をロイシンのない培地に移してやります(''...
-正確に言うとプラスミド上の'''leu2d'''遺伝子の活性が非常...
この状態では当然標的の遺伝子のコピー数も上昇し、それにと...
もしここで目的遺伝子の機能を知りたいのであれば、「細胞が...
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#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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しかしここでの目的は「遺伝子コピー数をどこまであげられる...
それはどうやって決められるのでしょうか?
実はこの2次選択の段階でおきている現象(遺伝子つなひき)に...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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上図はその概念図です。
+'''leu2d'''のコピー数が高いほど細胞の増殖は早い、つまり'...
+一方で、同じプラスミドDNA上の標的の遺伝子に上限がある(...
+これら2つの引っ張り合いがうまく釣り合ったところのコピー...
この実験では、マイクロプレートリーダで細胞の[[増殖速度の...
かなりややこしい遺伝学を使っていて、わかりにくいかもしれ...
すべての実験手法が完璧ではないように、この実験手法にもい...
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以下はgTOWの英語での説明
For a given gene, its ORF and promoter regulatory element...
There will be a tendency for cells to acquire more and mo...
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