Tyson2003の解説
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この解説論文は生命現象のモデリングの方法を学ぶには非常に...
-数式に対応した図式があまりにも簡素化されていて、実際の生...
-モデリング独特の簡略化・抽象化がどのように行われるのかと...
-これらの数学的記述を実際に動かす（シミュレーションする）...
などがあげられます。もちろんこれらはこの解説の主旨からは...
近年、分子生物学を学んだ者がこの論文で述べられているよう...
#br
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*微分方程式のモデルの読み方 [#ma54db90]
まず、Tysonの論文にいきなり登場する微分方程式をどう読めば...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#br
（a）は質量作用則（law of mass action: MA）を使ったごく一...
これが何を意味しているのかを本文で使われているネットワー...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#br
このモデルにもう少し情報を付け加えるとこうなります。
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
#br
蛋白質Rがその材料のアミノ酸（a.a.）からリボソームによって...
このモデル（と言うほどのものではありませんが）のSBML((SBM...
#br
これが一番単純な、蛋白質の変動を記述するモジュールです。T...
#br
[[線形と双曲線の信号ー応答曲線>Tyson2003/Page2]]のページへ
*常微分方程式を用いたモデリングのプロセス [#xf4d35be]
Tyson2003に登場するような微分方程式を用いて細胞内のネット...
+対象の生命現象に関わる遺伝子・蛋白質の機能的つながり（生...
+それらの機能的つながりを、連立微分方程式で記述する。
+それぞれの要素の初期値、反応速度などのパラメーターを設定...
+連立微分方程式を数値解析的に解く（シミュレーション）。
たとえば具体的なモデル((Chenら(2004)の出芽酵母細胞周期の...
#br
#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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この解説論文は生命現象のモデリングの方法を学ぶには非常に...
-数式に対応した図式があまりにも簡素化されていて、実際の生...
-モデリング独特の簡略化・抽象化がどのように行われるのかと...
-これらの数学的記述を実際に動かす（シミュレーションする）...
などがあげられます。もちろんこれらはこの解説の主旨からは...
近年、分子生物学を学んだ者がこの論文で述べられているよう...
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*微分方程式のモデルの読み方 [#ma54db90]
まず、Tysonの論文にいきなり登場する微分方程式をどう読めば...
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#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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（a）は質量作用則（law of mass action: MA）を使ったごく一...
これが何を意味しているのかを本文で使われているネットワー...
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#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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このモデルにもう少し情報を付け加えるとこうなります。
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#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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蛋白質Rがその材料のアミノ酸（a.a.）からリボソームによって...
このモデル（と言うほどのものではありませんが）のSBML((SBM...
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これが一番単純な、蛋白質の変動を記述するモジュールです。T...
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[[線形と双曲線の信号ー応答曲線>Tyson2003/Page2]]のページへ
*常微分方程式を用いたモデリングのプロセス [#xf4d35be]
Tyson2003に登場するような微分方程式を用いて細胞内のネット...
+対象の生命現象に関わる遺伝子・蛋白質の機能的つながり（生...
+それらの機能的つながりを、連立微分方程式で記述する。
+それぞれの要素の初期値、反応速度などのパラメーターを設定...
+連立微分方程式を数値解析的に解く（シミュレーション）。
たとえば具体的なモデル((Chenら(2004)の出芽酵母細胞周期の...
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#ref(http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/~hisaom/HMwiki/me...
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