オリゴ作成

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gTOW6000での「遺伝子領域」のクローニング †

• 各遺伝子について、隣接するORFの直前／直後*1までをプラスミドにクローンする（上図青い矢印）。
• Verified ORFならびにUncharacterized ORFをクローンする。
• 蛋白質をコードしていない染色体上の因子（RNA遺伝子やARSなど）、Dubious ORFは無視されている（上図オレンジ色の丸）。

プライマーデザインとGap-Repair Cloning †

• プライマー：48塩基（アダプター配列：25塩基　+　標的遺伝子と相同な配列：23塩基）
• 隣接するORFの23bpをプライマー配列とする。
• アダプター配列：
  • Up primer : cggccgctctagaactagtGGATCC*2
  • Down primer : attgggtaccgggccccccCTCGAG*3

• プライマーは、Saccharomyces Genome Databaseの塩基配列（28-JUL-2007リリース）をソースとしてスクリプトで自動設計し、増幅が見られなかったものについては、配列を変えて再設計しています。
• gTOW6000データシートには、これらのうちgTOW6000の最終セット構築に用いたプライマーセットを記載してあります。

• クローンをゲノム上にマップしたものはこちらです。