原著論文
論文の日本語での解説やエピソードなどは、守屋のウェブサイトの「成果発表/発表論文」をご覧ください(2016年以前のもの)。
- Higuchi R, Fujita Y, Namba S, Moriya H. Improving the Z3EV promoter system to create the strongest yeast promoter. FEMS Yeast Res. 2024 Jan 9;24:foae032. doi: 10.1093/femsyr/foae032. PMID: 39424601; PMCID: PMC11523633.
- Namba S, Moriya H. Toxicity of the model protein 3×GFP arises from degradation overload, not from aggregate formation. J Cell Sci. 2024 Jun 1;137(11):jcs261977. doi: 10.1242/jcs.261977. Epub 2024 Jun 12. PMID: 38766715.
- Sasaki S, Schlarmann P, Hanaoka K, Nishii H, Moriya H, Mu単iz M, Funato K., Protein sorting upon exit from the endoplasmic reticulum dominates Golgi biogenesis in budding yeast., FEBS Lett. 2024 Mar;598(5):548-555.
- Ono R, Saeki N, Kojima K, Moriya H, Sudo Y. Demonstration of iodide-dependent UVA-triggered growth inhibition in Saccharomyces cerevisiae cells and identification of its suppressive molecules. Biochem Biophys Res Commun. 2023 Jul 24;677:1-5. doi: 10.1016/j.bbrc.2023.07.048. PMID: 37523893
- Saeki N, Yamamoto C, Eguchi Y, Sekito T, Shigenobu S, Yoshimura M, Yashiroda Y, Boone C, Moriya H. Overexpression profiling reveals cellular requirements in the context of genetic backgrounds and environments. PLoS Genet. 2023 Apr 28;19(4):e1010732. doi: 10.1371/journal.pgen.1010732. PMID: 37115757.
- Namba S, Kato H, Shigenobu S, Makino T, Moriya H. Massive expression of cysteine-containing proteins causes abnormal elongation of yeast cells by perturbing the proteasome. G3 (Bethesda). 2022 Apr 29:jkac106. doi: 10.1093/g3journal/jkac106. PMID: 35485947.
- Horiuchi S, Namba S, Saeki N, Satoh A, Moriya H. Identification of uncharacterized proteins potentially localized to mitochondria (UPMs) in Saccharomyces cerevisiae using a fluorescent protein unstable in the cytoplasm. Yeast. 2022 May;39(5):303-311. doi: 10.1002/yea.3685. Epub 2021 Dec 27. PMID: 34913195.
- Kintaka R, Makanae K, Namba S, Kato H, Kito K, Ohnuki S, Ohya Y, Andrews BJ, Boone C, Moriya H., Genetic profiling of protein burden and nuclear export overload., Elife. 2020 Nov 04;9:e54080
- Ishikawa K, Ishihara A, Moriya H., Exploring the Complexity of Protein-Level Dosage Compensation that Fine-Tunes Stoichiometry of Multiprotein Complexes., PLoS Genet. 2020 Oct;16(10):e1009091.
- Saeki N, Eguchi Y, Kintaka R, Makanae K, Shichino Y, Iwasaki S, Kanno M, Kimura N, Moriya H., N-terminal deletion of Swi3 created by the deletion of a dubious ORF YJL175W mitigates protein burden effect in S. cerevisiae., Sci Rep. 2020 Jun 11;10(1):9500.
- Moriya H., The expression level and cytotoxicity of green fluorescent protein are modulated by an additional N-terminal sequence., AIMS Biophysics 2020, 7(2): 121-132
- Nemoto M, Iwaki S, Moriya H, Monden Y, Tamura T, Inagaki K, Mayama S, Obuse K., Comparative Gene Analysis Focused on Silica Cell Wall Formation: Identification of Diatom-Specific SET Domain Protein Methyltransferases., Mar Biotechnol (NY). 2020 Jun 03;22(4):551-563
- Mori Y, Yoshida Y, Satoh A, Moriya H., Development of an experimental method of systematically estimating protein expression limits in HEK293 cells., Sci Rep. 2020 Mar 16;10(1):4798.
- Abe-Kanoh N, Kunisue N, Myojin T, Chino A, Munemasa S, Murata Y, Satoh A, Moriya H, Nakamura Y., Yeast screening system reveals the inhibitory mechanism of cancer cell proliferation by benzyl isothiocyanate through down-regulation of Mis12., Sci Rep. 2019 Jun 20;9(1):8866.
- Eguchi Y, Makanae K, Hasunuma T, Ishibashi Y, Kito K, Moriya H., Estimating the protein burden limit of yeast cells by measuring the expression limits of glycolytic proteins., Elife. 2018 Aug 10;7. pii: e34595.
- Scharff-Poulsen P, Moriya H, Johnston M., Genetic Analysis of Signal Generation by the Rgt2 Glucose Sensor of ., G3 (Bethesda). 2018 Jul 31;8(8):2685-2696.
- Miura T, Moriya H, Iwai S., Assessing phagotrophy in the mixotrophic ciliate Paramecium bursaria using GFP-expressing yeast cells., FEMS Microbiol Lett. 2017 Jul 03;364(12).
- Ishikawa K, Makanae K, Iwasaki S, Ingolia NT, Moriya H., Post-Translational Dosage Compensation Buffers Genetic Perturbations to Stoichiometry of Protein Complexes., PLoS Genet. 2017 Jan 25;13(1):e1006554.
- Kintaka R, Makanae K, Moriya H., Cellular growth defects triggered by an overload of protein localization processes., Sci Rep. 2016;6:31774.
- Moriya H., Quantitative nature of overexpression experiments., Mol Biol Cell. 2015 Nov 5;26(22):3932-9.
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- Sasabe M, Shintani S, Kintaka R, Kaizu K, Makanae K, Moriya H., Evaluation of the lower protein limit in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae using TIPI-gTOW., BMC Syst Biol. 2014 Jan 7;8(1):2.
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- Chino A, Makanae K, Moriya H., Relationships between Cell Cycle Regulator Gene Copy Numbers and Protein Expression Levels in Schizosaccharomyces pombe., PLoS One. 2013;8(9):e73319.
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- Yamanishi M, Ito Y, Kintaka R, Imamura C, Katahira S, Ikeuchi A, Moriya H, Matsuyama T., A Genome-Wide Activity Assessment of Terminator Regions in Saccharomyces cerevisiae Provides a ″Terminatome″ Toolbox., ACS Synth Biol. 2013;2(6),337–47.
- Makanae K, Kintaka R, Makino T, Kitano H, Moriya H., Identification of dosage-sensitive genes in Saccharomyces cerevisiae using the genetic tug-of-war method., Genome Res. 2013 Feb;23(2):300-11.
- Moriya H, Makanae K, Watanabe K, Chino A, Shimizu-Yoshida Y., Robustness analysis of cellular systems using the genetic tug-of-war method., Mol Biosyst. 2012 Aug 28;8(10):2513-22.
- Ishiuchi K, Nakazawa T, Ookuma T, Sugimoto S, Sato M, Tsunematsu Y, Ishikawa N, Noguchi H, Hotta K, Moriya H, Watanabe K., Establishing a New Methodology for Genome Mining and Biosynthesis of Polyketides and Peptides through Yeast Molecular Genetics., Chembiochem. 2012 Apr 16;13(6):846-54.
- Moriya H, Chino A, Kapuy O, Csikász-Nagy A, Novák B., Overexpression limits of fission yeast cell-cycle regulators in vivo and in silico., Mol Syst Biol. 2011;7:556.
- Kaizu K, Ghosh S, Matsuoka Y, Moriya H, Shimizu-Yoshida Y, Kitano H., A comprehensive molecular interaction map of the budding yeast cell cycle., Mol Syst Biol. 2010 Sep 21;6:415.
- Kaizu K, Moriya H, Kitano H., Fragilities caused by dosage imbalance in regulation of the budding yeast cell cycle., PLoS Genet. 2010;6(4):e1000919.
- Chino A, Watanabe K, Moriya H., Plasmid Construction Using Recombination Activity in the Fission Yeast Schizosaccharomyces pombe., PLoS One. 2010;5(3):e9652.
- Moriya H, Shimizu-Yoshida Y, Kitano H., In vivo robustness analysis of cell division cycle genes in Saccharomyces cerevisiae., PLoS Genet. 2006 Jul;2(7):e111.
- Kim JH, Brachet V, Moriya H, Johnston M., Integration of transcriptional and posttranslational regulation in a glucose signal transduction pathway in Saccharomyces cerevisiae., Eukaryot Cell. 2006 Jan;5(1):167-73.
- Ishiyama T, Dharmarajan S, Hayama M, Moriya H, Grapperhaus K, Patterson GA., Inhibition of nuclear factor kappaB by IkappaB superrepressor gene transfer ameliorates ischemia-reperfusion injury after experimental lung transplantation., J Thorac Cardiovasc Surg. 2005 Jul;130(1):194-201.
- Moriya H, Johnston M., Glucose sensing and signaling in Saccharomyces cerevisiae through the Rgt2 glucose sensor and casein kinase I., Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Feb 10;101(6):1572-7.
- Moriya H, Shimizu-Yoshida Y, Omori A, Iwashita S, Katoh M, Sakai A., Yak1p, a DYRK family kinase, translocates to the nucleus and phosphorylates yeast Pop2p in response to a glucose signal., Genes Dev. 2001 May 15;15(10):1217-28.
- Moriya H, Isono K., Analysis of genetic interactions between DHH1, SSD1 and ELM1 indicates their involvement in cellular morphology determination in Saccharomyces cerevisiae., Yeast. 1999 Apr;15(6):481-96.
- Moriya H, Kasai H, Isono K., Cloning and characterization of the hrpA gene in the terC region of Escherichia coli that is highly similar to the DEAH family RNA helicase genes of Saccharomyces cerevisiae., Nucleic Acids Res. 1995 Feb 25;23(4):595-8.
総説・研究解説
- 守屋央朗、小野千由貴「過剰発現プロファイリングADOPT法を用いたS.cerevisiaeのワイン醸造用ブドウ果汁への適応性評価」 岡山大学農学部学術報告113巻
- 守屋央朗「遺伝子過剰発現プロファイリングによる酵母の増殖制限因子の探索」バイオサイエンスとインダストリー 2024年1月号
- 守屋央朗 「酵母とシステムバイオロジー:遺伝子発現量を正確に予測するAIを例として」遺伝子医学2023年1月号
- 守屋央朗「微生物,特に出芽酵母の形質転換法についてのよもやま話」生物工学会誌2022年12月号
- 難波匠太郎、守屋央朗「過剰発現が引き起こす相分離構造と細胞毒性の評価」実験医学別冊 相分離解析プロトコール
- 守屋央朗「リソース過負荷の遺伝的プロファイリング」生物物理 vol.62 No.2 pp134-136, 2022
- 守屋央朗 「たくさんつくれるタンパク質に隠された秘密」 現代化学2021年11月号
- 佐伯望、守屋央朗 「酵母2μプラスミドのコピー数変動の数理的解析」 岡山大学農学部学術報告109巻
- 守屋央朗 「生体内のタンパク質の発現量はどのような原理で決まっているのか? -プロテオームの拘束条件を探る」生体の科学2018年2月号
- 石川浩史、江口優一、守屋央朗「細胞内パラメータを測定するという研究志向」実験医学 2017年3月 増刊 Vol.35 No.5
- 守屋央朗「細胞のタンパク質発現リソース配分とタンパク質発現キャパシティ」 化学と生物 2016年8月号 pp555 – 561 PDFファイル
- 守屋央朗、蒔苗浩司「酵母の組換え能を利用した簡便・高効率なプラスミドの構築」(クローズアップ実験法) 実験医学 2014年8月号 PDFファイル
- 守屋央朗「生命システムのロバストネスとは何か?」 細胞工学 2014年1月号特集(監修)PDFファイル
- 守屋央朗「タンパク質の発現量の変化に対する細胞システムのロバストネスを測る」 細胞工学 2014年1月号 pp19-25 PDFファイル
- 守屋央朗「酵母の持つすべての遺伝子の限界コピー数の計測」 生物物理 vol.53 No.6 pp323-326, 2013
- 金高令子、蒔苗浩司、守屋央朗「酵母のすべての遺伝子の「限界コピー数」を測る」 実験医学 2013年6月号 pp1401-1405
- 恒松雄太 守屋央朗 渡辺賢二「出芽酵母発現システムを利用した天然物の生物合成」 化学と生物 2012年3月号 pp163-174
- 守屋央朗「生命システムのロバストネスを探る・出芽酵母の研究を中心として」 化学と生物 2009年4月号 pp269-274 PDFファイル
- 守屋央朗「細胞システムのロバストネスの測定」 現代化学 2009年3月号(No.456) pp26-32 PDFファイル
- 守屋央朗「頑健さを支えるしなやかさを計測する」 生命誌58「頑健さを支えるしなやかさを計測する」
- 守屋央朗 北野宏明「gTOW法によるロバストネスの測定」 実験医学(2007) Vol.25 No.2 増刊「ゲノム情報と生命現象の統合的理解」 pp191-197, 2007
- 守屋央朗「Saccharomyces cerevisiaeのグルコース感知機構」 バイオサイエンスとインダストリー Vol.63 No.6 pp.30-33, 2005
- 東剛人 守屋央朗 北野宏明「真核生物のセルサイクルにおける基本システムの理解」システム/制御/情報 Vol. 50 No. 8(システムと生命特集号)pp.309-314, 2006
書籍
- 「コンピュータモデリングと物質生産」 遺伝子から見た応用微生物学(熊谷英彦 他編)コラム 2008年01月発行
- 「出芽酵母のシステム生物学」 酵母のすべて(大隅 良典/下田 親 編)XI章11.3 2007年9月発行
特許出願
- 出願番号2010-181279「カビ類ポリケチド合成遺伝子の酵母での異種発現」(渡辺、守屋)
- 出願番号2007-290660「シゾサッカロミセス属微生物用プラスミドベクター」(守屋、北野)
- 出願番号2007-290659「サッカロミセス属微生物用プラスミドベクター」(守屋、吉田、北野)
研究費等
- 2006年10月-2010年3月 JST 戦略的創造事業 さきがけ「生命システムの動作原理と基盤技術」領域
- 2009年-2010年度 科学研究費補助金 新学術領域「遺伝情報場」 公募研究
- 2009年-2012年度 NEDO 産業技術研究助成事業(分担)
- 2010年−2012年度 JST 戦略的国際科学技術協力推進事業「日本—英国(BBSRC)研究交流(システムバイオロジー)」
- 科研費データベース(守屋)