酵母ミトコンドリアの（ちゃんとした）タンパク質カタログ
Landscape of submitochondrial protein distribution.Vögtle FN, Burkhart JM, Gonczarowska-Jorge H, Kücükköse C, …
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システムバイオロジー, テクノロジー, 大規模解析, 論文, 酵母
大規模解析
それはスクリーニング？ それともプロファイリング？
先日とあるセミナーがありました。内容は、様々な条件でメタボローム解析を行いそこから得られた結果を考察するというものでした。解析結果の考察では、特定のメタボライトがその条件下でどのような化学反応を受けて変化しているかの考察…
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（現在最強の）タンパク質局在データベース
出芽酵母（S.cerevisiae）のタンパク質の局在解析については、USCF（当時）のErin O’Sheaらの金字塔的研究が有名です（文献１）。出芽酵母のほぼすべてのタンパク質をGFP融合タンパク質として…
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酵母の遺伝子ライブラリーあれこれ (2)
ずいぶん間が空いてしまいましたが、「酵母の遺伝子ライブラリーあれこれ」のその２です。学会で「続きを書いてほしい」というリクエストをもらいましたので頑張って書きたいと思います。その１のエントリーはこちらです。 前回は、ラン…
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ナノポアシーケンサーMinIONインプレッション
Nanoporeシーケンサーは、DNAを一分子ずつ小さな穴（nanopore）を通し、AGCTの塩基が通る際の電流変化の違いを利用してDNAの塩基配列を解読しようとする、次次世代（？）のシーケンサーです。DNAを断片化し…
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酵母の遺伝子ライブラリーあれこれ (1)
このエントリー（シリーズ）では、出芽酵母（S. cerevisiae）の遺伝子を対象として作られてきた（そして手に入る）遺伝子ライブラリーについてまとめていきたいと思います。長くなったのでエントリーを分けて書いていきます…
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タンパク質を発現量で分けて眺めるだけでも面白い
「Proteomap : プロテオームを可視化する新しい手法」で書きましたプロテオマップですが、やっぱりコレはすごいです。色々なタンパク質の機能がそれなりにちゃんと分かっていて、それぞれがどれくらいの量発現しているかがち…
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トランスポゾンによるローラー作戦でゲノムの機能領域をマッピングする
Functional mapping of yeast genomes by saturated transposition. Michel AH, Hatakeyama R, Kimmig P, Arter M, Pe…
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