出芽酵母遺伝子の機能がすべてKnownになる日
突然ですが、出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）のゲノムには何種類の遺伝子（タンパク質をコードした領域）があるでしょうか？ 大抵の酵母研究者は、「だいたい6000」と答えると思います。「だいたい」…
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最新記事
YeastSpotter：出芽酵母細胞を認識するツール
はじめに 画像上に存在する物体を認識・分離することを「セグメンテーション」と言い、セグメンテーションされた物体は「オブジェクト化」されたと言います。セグメンテーションは画像解析の第一歩であるとともに、最も重要な処理でもあ…
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“ちょうどいい感じ”のDNAの3Dモデル
久しぶりの3Dプリンターシリーズ（？）です。 今回はずばりDNA！！ 講義での話ですが、DNAの持つ特徴、ポリヌクレオチドであることや二重らせんのヒモであることを説明するときに模型があるととても便利です。 ヒモとしての性…
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異数性細胞は低浸透圧様のストレスを受けている
Hypo-osmotic-like stress underlies general cellular defects of aneuploidy. Tsai HJ, Nelliat AR, Choudhury MI, …
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ミトコンドリアの進化に向けた酵母の細胞内共生体の作成
Engineering yeast endosymbionts as a step toward the evolution of mitochondria. Mehta AP, Supekova L, Che…
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酵母ミトコンドリアの（ちゃんとした）タンパク質カタログ
Landscape of submitochondrial protein distribution.Vögtle FN, Burkhart JM, Gonczarowska-Jorge H, Kücükköse C, …
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システムバイオロジー, テクノロジー, 大規模解析, 論文, 酵母
それはスクリーニング？ それともプロファイリング？
先日とあるセミナーがありました。内容は、様々な条件でメタボローム解析を行いそこから得られた結果を考察するというものでした。解析結果の考察では、特定のメタボライトがその条件下でどのような化学反応を受けて変化しているかの考察…
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微生物実験でのイエローチップの（驚くべき）使い方
今日は実験手法についてのエントリーです。 マイクロピペッター用のイエローチップ、私の研究室では微生物実験に使っています。下の写真は大腸菌の液体培養。ピペットマンにイエローチップをつけて、チップで寒天培地上のコロニーをちょ…
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（現在最強の）タンパク質局在データベース
出芽酵母（S.cerevisiae）のタンパク質の局在解析については、USCF（当時）のErin O’Sheaらの金字塔的研究が有名です（文献１）。出芽酵母のほぼすべてのタンパク質をGFP融合タンパク質として…
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ウェブページ, システムバイオロジー, テクノロジー, 大規模解析, 酵母
酵母の遺伝子ライブラリーあれこれ (2)
ずいぶん間が空いてしまいましたが、「酵母の遺伝子ライブラリーあれこれ」のその２です。学会で「続きを書いてほしい」というリクエストをもらいましたので頑張って書きたいと思います。その１のエントリーはこちらです。 前回は、ラン…
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