CellDesigner4.3でCell Cycleモデルを再構築してみよう（３）
前回「CellDesigner4.3でCell Cycleモデルを再構築してみよう（２）」の続きです。 ダイアグラムが完成しましたのでパラメーターや数式をいれてモデルを完成させます。 数理モデルの構築（1/…
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論文
CellDesigner4.3でCell Cycleモデルを再構築してみよう（２）
前回「CellDesigner4.3でCell Cycleモデルを再構築してみよう（１）」の続きです。 それでは早速始めてみましょう。まず初めにすることはモデルのダイアグラム（線図）を作ることです。CellDesigne…
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CellDesigner4.3でCell Cycleモデルを再構築してみよう（１）
出芽酵母の細胞周期の数理モデル 細胞周期の数理モデルとして有名なのは、John Tysonのグループが2004年に発表した、”Chen2004モデル”です。発表されたのはもう10年も前ですが、出芽…
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スピンドルチェックポイントのロバストネスを決める要因
Determinants of robustness in spindle assembly checkpoint signalling. Heinrich S, Geissen EM, Kamenz J, Trautm…
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システムバイオロジー, ロバストネス, 細胞周期, 論文, 酵母
出芽酵母と（分裂酵母とHeLa細胞）のタンパク質のコピー数測定
Minimal, encapsulated proteomic-sample processing applied to copy-number estimation in eukaryotic cells. Kulak…
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システムバイオロジー, 要チェック論文, 論文, 酵母
出芽酵母の統合的フェノミクスによって明らかになった表現型多様性の構造
Integrative phenomics reveals insight into the structure of phenotypic diversity in budding yeast. Skelly DA, …
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システムバイオロジー, テクノロジー, モデリング, 論文, 酵母
ゲノム重複とACE2の変異により、出芽酵母は多細胞化し早く沈殿するように進化する。
Genome duplication and mutations in ACE2 cause multicellular, fast-sedimenting phenotypes in evolved Saccharom…
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酵母の熱ショックでの生存に必要な遺伝子は、代謝や信号伝達に関わっていて、熱ショックで誘導される遺伝子とはほとんど一致しない。
Yeast metabolic and signaling genes are required for heat-shock survival and have little overlap with the heat…
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エッセイ, システムバイオロジー, 論文, 酵母
遺伝子発現は円を描く。mRNA分解に関わる因子はmRNA合成も手伝う。
Gene expression is circular: factors for mRNA degradation also foster mRNA synthesis. Haimovich G, Medina DA, …
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システムバイオロジー, ロバストネス, 要チェック論文, 論文, 酵母
S. cerevisiaeにRNAiマシナリーがない理由
Compatibility with killer explains the rise of RNAi-deficient fungi. Drinnenberg IA, Fink GR, Bartel DP. Scien…
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