シリーズ過剰発現・第2回「遺伝学の３つのフェーズ」
シリーズ過剰発現、第２回は過剰発現を遺伝学の歴史の文脈の上で捉え、過剰発現の使われ方と考え方にどのような変遷があったのかを考えてみたいと思います。ここで紹介する遺伝学のフェーズの変化のなかで、特に３番目の「次世代遺伝学」…
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最新記事
シリーズ過剰発現・第1回「過剰発現とは？」
過剰発現（overexpression）とは、遺伝子が通常よりも多く発現し、それによって生命の機能に何らかの影響が及ぼされることを指す言葉です。この言葉は、20万報近い論文で使われている一般的な生物学用語ですが、この言葉…
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酵母でSARS-CoV-2ゲノムを再構築
相同組換え活性の強い出芽酵母は、初めての合成ゲノムの構築に用いられました。酵母で容易にDNAを連結できることは古くから知られていましたが、この1000kbにも及ぶマイコプラズマゲノムの再構築によって、酵母で長鎖のDNAを…
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DNAポリメラーゼの3Dモデルから学ぶこと？
今回は久しぶりに３Dプリンターで打ち出したモデルの解説（動画）です。 打ち出したタンパク質は以下です。（）の中はPDBのIDです。 大腸菌DNAポリメラーゼI クレノウフラグメント（1KLD） TaqDNAポリメラーゼ（…
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野生の酵母が異数性に強い理由（というより実験室酵母が異数性に弱い理由）が判明した
The genetic basis of aneuploidy tolerance in wild yeast. Hose J, Escalante LE, Clowers KJ, Dutcher HA, Robinso…
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酵母研究ルネッサンス令和元年を開催しました
2019年12月2日 博多で「酵母研究ルネッサンス令和元年」を開催しました。 セッション１：酵母はテクノロジーギークの実験場である 岡田 悟 （九大） ごく 少数の タンパク質 分子近接 イベントを 生細胞…
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出芽酵母遺伝子の機能がすべてKnownになる日
突然ですが、出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）のゲノムには何種類の遺伝子（タンパク質をコードした領域）があるでしょうか？ 大抵の酵母研究者は、「だいたい6000」と答えると思います。「だいたい」…
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YeastSpotter：出芽酵母細胞を認識するツール
はじめに 画像上に存在する物体を認識・分離することを「セグメンテーション」と言い、セグメンテーションされた物体は「オブジェクト化」されたと言います。セグメンテーションは画像解析の第一歩であるとともに、最も重要な処理でもあ…
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“ちょうどいい感じ”のDNAの3Dモデル
久しぶりの3Dプリンターシリーズ（？）です。 今回はずばりDNA！！ 講義での話ですが、DNAの持つ特徴、ポリヌクレオチドであることや二重らせんのヒモであることを説明するときに模型があるととても便利です。 ヒモとしての性…
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異数性細胞は低浸透圧様のストレスを受けている（追記あり）
Hypo-osmotic-like stress underlies general cellular defects of aneuploidy. Tsai HJ, Nelliat AR, Choudhury MI, …
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