シリーズ過剰発現・第5回「過剰発現に用いられるプロモーター」
本エントリーでは、出芽酵母の過剰発現で用いられるプロモータについてすこし詳しく解説します。 プロモーターもいくつかに分類できます。恒常的（構成的）に強く発現するプロモーター、これは解糖系酵素TDH3／のプロモーターやアク…
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最新記事
シリーズ過剰発現・第4回「過剰発現ライブラリーの種類」
前回の続きです。人工的に過剰発現を起こす方法、特に出芽酵母Saccharomyces cerevisiae のシステマティックな過剰発現実験に用いられた方法を解説します。これらは前回もお見せした、以下の論文リストで使われ…
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シリーズ過剰発現・第3回「過剰発現を起こす3つの方法 」
前回は、ポストゲノムの主要なアプローチとして過剰発現実験があることを解説しました。本エントリーでは、出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）で行われたきた体系的な過剰発現実験の例を説明し、それらがどん…
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シリーズ過剰発現・第2回「遺伝学の３つのフェーズ」
シリーズ過剰発現、第２回は過剰発現を遺伝学の歴史の文脈の上で捉え、過剰発現の使われ方と考え方にどのような変遷があったのかを考えてみたいと思います。ここで紹介する遺伝学のフェーズの変化のなかで、特に３番目の「次世代遺伝学」…
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シリーズ過剰発現・第1回「過剰発現とは？」
過剰発現（overexpression）とは、遺伝子が通常よりも多く発現し、それによって生命の機能に何らかの影響が及ぼされることを指す言葉です。この言葉は、20万報近い論文で使われている一般的な生物学用語ですが、この言葉…
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酵母でSARS-CoV-2ゲノムを再構築
相同組換え活性の強い出芽酵母は、初めての合成ゲノムの構築に用いられました。酵母で容易にDNAを連結できることは古くから知られていましたが、この1000kbにも及ぶマイコプラズマゲノムの再構築によって、酵母で長鎖のDNAを…
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DNAポリメラーゼの3Dモデルから学ぶこと？
今回は久しぶりに３Dプリンターで打ち出したモデルの解説（動画）です。 打ち出したタンパク質は以下です。（）の中はPDBのIDです。 大腸菌DNAポリメラーゼI クレノウフラグメント（1KLD） TaqDNAポリメラーゼ（…
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野生の酵母が異数性に強い理由（というより実験室酵母が異数性に弱い理由）が判明した
The genetic basis of aneuploidy tolerance in wild yeast. Hose J, Escalante LE, Clowers KJ, Dutcher HA, Robinso…
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酵母研究ルネッサンス令和元年を開催しました
2019年12月2日 博多で「酵母研究ルネッサンス令和元年」を開催しました。 セッション１：酵母はテクノロジーギークの実験場である 岡田 悟 （九大） ごく 少数の タンパク質 分子近接 イベントを 生細胞…
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出芽酵母遺伝子の機能がすべてKnownになる日
突然ですが、出芽酵母（Saccharomyces cerevisiae）のゲノムには何種類の遺伝子（タンパク質をコードした領域）があるでしょうか？ 大抵の酵母研究者は、「だいたい6000」と答えると思います。「だいたい」…
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