実験結果

今日は実験手法についてのエントリーです。 マイクロピペッター用のイエローチップ、私の研究室では微生物実験に使っています。下の写真は大腸菌の液体培養。ピペットマンにイエローチップをつけて、チップで寒天培地上のコロニーをちょ…
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Nanoporeシーケンサーは、DNAを一分子ずつ小さな穴（nanopore）を通し、AGCTの塩基が通る際の電流変化の違いを利用してDNAの塩基配列を解読しようとする、次次世代（？）のシーケンサーです。DNAを断片化し…
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CRISPR-Cas9によるゲノム編集技術、近いうちに間違いなくノーベル賞をとる革新的技術です。我が酵母においても、この技術を使って盛んにゲノムの大規模な編集が行われ、毎日のように論文が出ています。私も一応この実験系を動…
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以前、酵母で死ぬほどGFPを発現してみたら酵母のコロニーが幻想的な緑色になることをこのブログで書きました。今回、たまたま大腸菌で思いっきりGFPを発現する機会がありましたので、その観察結果を。条件は、pGLO in TO…
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以前このブログで、「酵母で死ぬほどGFPを発現してみました。」という実験を紹介しました。 死ぬほどGFP（緑色蛍光タンパク質）を発現した酵母（GFP酵母と呼ぶことにします）のコロニーは肉眼でも蛍光緑に見えます。培養液も緑…
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ウエスタンブロッティングー標的のタンパク質がいろいろな条件でどれくらい作られているのかを示す事に使われたりします。 分子生物学者はこの技術が大好き（？）で、論文のリバイスなどでもレフェリーが、「ウエスタンブロッティングを…
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よくわからない実験結果がでたのでここにアップします。 これまでずっとyEGFPという酵母のコドンに最適化したEGFP（enhanced GFP）を使ってきたのですが、最近さらにフォールディングが早いGFPを使い始めました…
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多数のサイズの違うサンプルを電気泳動した時に、そのサイズがちゃんとあっているかを皆さんはどうやって評価しているでしょうか？ 下の泳動像は私たちの実際のサンプルです。コロニーPCRでインサートのDNA断片を増幅し、アガロー…
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ちまたで騒がれているSTAP現象、「死んだ細胞の自家蛍光をOct4-GFPの蛍光と勘違いしているんじゃないか」という話もよく耳にします。 実際、Youtubeに上げられている動画をじっくり見てみると、緑色に光り始める細胞…
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