Wikipediaの「シグナル配列」はどこから来たのか？
シグナルペプチドとは、そもそもの意味は小胞輸送されるタンパク質が、合成されるときに小胞体に入り込むための「シグナル」となるN末端の短いアミノ酸配列のことです。Wikipediaでシグナルペプチドを調べてみると、今はどうや…
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用語解説
負のフィードバックは、酵母の転写因子制御に「変異に対するロバストネス」を付与する。
Negative feedback confers mutational robustness in yeast transcription factor regulation. Denby CM, Im JH, Yu …
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システムバイオロジー, ロバストネス, 用語解説, 論文, 酵母
「Systems Biology」の定義
近藤滋先生の「生命科学の明日はどっちだ」でも揶揄されています、システムバイオロジーですが、日本でやたらとこの言葉にアレルギーを持っている研究者がいるのに対して、世界では普通に使われています。 先日、「酵母コロキアム」で紹…
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ジンクピリチオンの分子生物学的な効果
いよいよ今週水曜日に、「ジンクピリチオン祭り in 分子生物学会」がひらかれます。私は進行をまかされていて、Twitterでもジンクピリチオンワード募集を行なっています。 「ジンクピリチオン」という言葉でTweetを集め…
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「矛盾した制御ループ（iFFL）」と「理にかなった制御ループ（cFFL）」
とある解説記事を読んでいて、「矛盾した制御ループ」と「理にかなった制御ループ」という言葉が出てきた。 これはどんな制御ループの事を言っているのだろうとよくよく読んでみると、矛盾した制御ループが、incoherent Fe…
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エッセイ, システムバイオロジー, 更新記録, 用語解説
統合的なコンピュータモデル、ロバストネスと脆弱性
別件で用語解説を書いたのでこのブログに載せておく。 — 統合的なコンピュータモデル：細胞が持つ特定のシステム（例えば細胞周期制御システム）で働く分子とその相互作用を詳細に記述することで作られるコンピュータ（数…
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