テクノロジー | 酵母とシステムバイオロジー

クライオEMがタンパク質３Dプリンティングに与えた衝撃

今回も、なぜか（？）あまり人気の無いタンパク質３Dプリンティングのエントリーです。 2017年のノーベル化学賞の受賞対象ともなったクライオEM（低温電子顕微鏡法）によって、次々とタンパク質の構造が明らかになっています。ク…
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相同組換え活性の強い出芽酵母は、初めての合成ゲノムの構築に用いられました。酵母で容易にDNAを連結できることは古くから知られていましたが、この1000kbにも及ぶマイコプラズマゲノムの再構築によって、酵母で長鎖のDNAを…
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はじめに画像上に存在する物体を認識・分離することを「セグメンテーション」と言い、セグメンテーションされた物体は「オブジェクト化」されたと言います。セグメンテーションは画像解析の第一歩であるとともに、最も重要な処理でもあ…
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久しぶりの3Dプリンターシリーズ（？）です。今回はずばりDNA！！講義での話ですが、DNAの持つ特徴、ポリヌクレオチドであることや二重らせんのヒモであることを説明するときに模型があるととても便利です。ヒモとしての性…
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Engineering yeast endosymbionts as a step toward the evolution of mitochondria. Mehta AP, Supekova L, Che…
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Landscape of submitochondrial protein distribution.Vögtle FN, Burkhart JM, Gonczarowska-Jorge H, Kücükköse C, …
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今日は実験手法についてのエントリーです。マイクロピペッター用のイエローチップ、私の研究室では微生物実験に使っています。下の写真は大腸菌の液体培養。ピペットマンにイエローチップをつけて、チップで寒天培地上のコロニーをちょ…
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出芽酵母（S.cerevisiae）のタンパク質の局在解析については、USCF（当時）のErin O’Sheaらの金字塔的研究が有名です（文献１）。出芽酵母のほぼすべてのタンパク質をGFP融合タンパク質として…
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以前このブログで紹介した、「酵母の染色体を人間が全部作り直そう」というプロジェクトは、その後、国際プロジェクト「Synthetic Yeast 2.0（Sc2.0）」に発展し、2017年3月には30％が終了したという中間…
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Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell. Ma J, Yu MK, Fong S, Ono K, Sa…
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