用語解説 | 酵母とシステムバイオロジー

パスツール効果なんて存在しない？(２)

以前、「パスツール効果なんて存在しない？」というエントリーを書きました。要約すると「高校生物の教科書に書かれている『パスツール効果』は、S. cerevisiae（#1）の通常の培養条件では観察されない」というものです。…
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TOYOBOが販売しているPCR用の耐熱性DNAポリメラーゼに「KOD DNAポリメラーゼ」というものがあります。正確性や伸長性が高いということで利用価値が高く、この改良版が次々と販売されてきました。 KOD -plus…
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覚書です。「過剰発現」で最も引用されている論文はどんなものでしょうか？ Google Scholarで検索したトップファイブを以下にリストします。上位３位が、がんに関係するもの。がんで見られる特定のタンパク質の過剰発…
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このブログ、自分の覚書のためにも書くことにしています。読者の皆さんにとっては、「え！？そんなことも知らなかったの？」とか「は？それが何か？」と思われる内容もあるかもしれません。でも、私が長年知らなかった（あるいは忘れて…
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最近、Twitterのタイムラインに「発現小町」というネタが流れてきました。「この遺伝子が全然発現していないようなのですがいったいどうなっているのでしょうか」「あ、ここにストップコドンが入っちゃってます。」「ご指摘，あ…
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書き物をしていて「ロバストネス」をちゃんと説明する必要があると感じたのですがスペースがなかったので、とりあえずブログにアップします。今後このボリュームをふくらませていくつもりです。ロバストネスについては守屋の個人的ページ…
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酵母の遺伝子組み換え実験で古くから用いられてきたものに、栄養要求性（auxotrophic）マーカーがあります。例えば、染色体上のロイシンの合成酵素の遺伝子LEU2を壊した株では、自身でロイシンを合成できないためロイシ…
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シグナルペプチドとは、そもそもの意味は小胞輸送されるタンパク質が、合成されるときに小胞体に入り込むための「シグナル」となるN末端の短いアミノ酸配列のことです。Wikipediaでシグナルペプチドを調べてみると、今はどうや…
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Negative feedback confers mutational robustness in yeast transcription factor regulation. Denby CM, Im JH, Yu …
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近藤滋先生の「生命科学の明日はどっちだ」でも揶揄されています、システムバイオロジーですが、日本でやたらとこの言葉にアレルギーを持っている研究者がいるのに対して、世界では普通に使われています。先日、「酵母コロキアム」で紹…
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