酵母

以前このブログで紹介した、「酵母の染色体を人間が全部作り直そう」というプロジェクトは、その後、国際プロジェクト「Synthetic Yeast 2.0（Sc2.0）」に発展し、2017年3月には30％が終了したという中間…
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Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell. Ma J, Yu MK, Fong S, Ono K, Sa…
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Defining the physiological role of SRP in protein-targeting efficiency and specificity. Costa EA, Subramanian …
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以前、「パスツール効果なんて存在しない？」というエントリーを書きました。要約すると「高校生物の教科書に書かれている『パスツール効果』は、S. cerevisiae（#1）の通常の培養条件では観察されない」というものです。…
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Nanoporeシーケンサーは、DNAを一分子ずつ小さな穴（nanopore）を通し、AGCTの塩基が通る際の電流変化の違いを利用してDNAの塩基配列を解読しようとする、次次世代（？）のシーケンサーです。DNAを断片化し…
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このエントリー（シリーズ）では、出芽酵母（S. cerevisiae）の遺伝子を対象として作られてきた（そして手に入る）遺伝子ライブラリーについてまとめていきたいと思います。長くなったのでエントリーを分けて書いていきます…
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Functional mapping of yeast genomes by saturated transposition. Michel AH, Hatakeyama R, Kimmig P, Arter M, Pe…
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1つの細胞あたりどれくらいのタンパク質（分子数）があるのでしょうか？ これは割と単純な問いですが、研究者でもぱっと応えられる人は多くないように思います。 細胞の体積あたりのタンパク質の重量とタンパク質の平均のアミノ酸数か…
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以前このブログで、「酵母で死ぬほどGFPを発現してみました。」という実験を紹介しました。 死ぬほどGFP（緑色蛍光タンパク質）を発現した酵母（GFP酵母と呼ぶことにします）のコロニーは肉眼でも蛍光緑に見えます。培養液も緑…
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Gene duplication can impart fragility, not robustness, in the yeast protein interaction network. Diss G, Gagno…
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