出芽酵母のすべての「ターミネーター」の活性測定
A Genome-Wide Activity Assessment of Terminator Regions inSaccharomyces cerevisiae Provides a ″Terminatome″ To…
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システムバイオロジー, 論文, 酵母
論文
バーコード化された過剰発現系を使った酵母の遺伝子機能解析
Functional analysis with a barcoder yeast gene overexpression system. Douglas AC, Smith AM, Sharifpoor S, Yan …
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システムバイオロジー, 論文, 酵母
酵母のダイオキシックシフトのマルチオミックス解析
Temporal system-level organization of the switch from glycolytic to gluconeogenic operation in yeast. Zampar G…
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システムバイオロジー, モデリング, 論文, 酵母
RNAseqとマイクロアレイによるmRNAの定量ーある解析例
別件で、自前でとったマイクロアレイによるmRNAの発現量の解析データと、パブリッシュされているRNAseqによる同様なデータを比較する機会があったので、覚え書きの意味も含めてブログに書いておきます。 まず、条件ですが、私…
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gTOW6000論文・超（長）解説を書きました。
遺伝子つなひき法による出芽酵母の量感受性遺伝子の同定 Makanae K, Kintaka R, Makino T, Kitano H, Moriya H., Identification of dosage-sensi…
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分裂酵母で“使える”誘導型のプロモーターが見つかるのはいつの日か？
遺伝子の発現を自在にON/OFFできるプロモーターがあれば、そのプロモーターの制御下に自分の興味のある遺伝子をおいてやることで、その遺伝子の機能を多方面で調べることができます。 必須の遺伝子であれば、ON→OFF時にどん…
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遺伝子型から表現型を予測する全細胞レベルのコンピュータモデル
A whole-cell computational model predicts phenotype from genotype. Karr JR, Sanghvi JC, Macklin DN, Gutschow M…
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システムバイオロジー, テクノロジー, モデリング, 論文
集団レベルと単一細胞レベルにおける、モデル予測による遺伝子発現の長期的な制御
Long-term model predictive control of gene expression at the population and single-cell levels. Uhlendorf J, M…
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システムバイオロジー, テクノロジー, モデリング, 論文, 酵母
タンパク質のダイナミクスを測る、蛍光蛋白質タイマー
Tandem fluorescent protein timers for in vivo analysis of protein dynamics. Khmelinskii A, Keller PJ, Bartosik…
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システムバイオロジー, 論文, 酵母
「パスツール効果」なんて存在しない？
大学の講義のために高校の生物の教科書を読んでいてこんな記述がありました。 「酵母菌は、酸素が少ないときには嫌気呼吸を行なって多量のグルコースを消費するが、酸素が多くなると、グルコースの消費量が減少する。この現象はパスツー…
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