Nanoporeシーケンサーは、DNAを一分子ずつ小さな穴（nanopore）を通し、AGCTの塩基が通る際の電流変化の違いを利用してDNAの塩基配列を解読しようとする、次次世代（？）のシーケンサーです。DNAを断片化し…
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CRISPR-Cas9によるゲノム編集技術、近いうちに間違いなくノーベル賞をとる革新的技術です。我が酵母においても、この技術を使って盛んにゲノムの大規模な編集が行われ、毎日のように論文が出ています。私も一応この実験系を動…
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このエントリー（シリーズ）では、出芽酵母（S. cerevisiae）の遺伝子を対象として作られてきた（そして手に入る）遺伝子ライブラリーについてまとめていきたいと思います。長くなったのでエントリーを分けて書いていきます…
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以前、酵母で死ぬほどGFPを発現してみたら酵母のコロニーが幻想的な緑色になることをこのブログで書きました。今回、たまたま大腸菌で思いっきりGFPを発現する機会がありましたので、その観察結果を。条件は、pGLO in TO…
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エントリー名、少し変えました（旧エントリー名「大腸菌の形質転換ではヒートショックも後培養もいらない」）。内容もコメントに合わせて若干修正しています。2019.5.18 追記をしました。 大腸菌の形質転換（トランスフォーメ…
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「Proteomap : プロテオームを可視化する新しい手法」で書きましたプロテオマップですが、やっぱりコレはすごいです。色々なタンパク質の機能がそれなりにちゃんと分かっていて、それぞれがどれくらいの量発現しているかがち…
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Functional mapping of yeast genomes by saturated transposition. Michel AH, Hatakeyama R, Kimmig P, Arter M, Pe…
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1つの細胞あたりどれくらいのタンパク質（分子数）があるのでしょうか？ これは割と単純な問いですが、研究者でもぱっと応えられる人は多くないように思います。 細胞の体積あたりのタンパク質の重量とタンパク質の平均のアミノ酸数か…
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以前このブログで、「酵母で死ぬほどGFPを発現してみました。」という実験を紹介しました。 死ぬほどGFP（緑色蛍光タンパク質）を発現した酵母（GFP酵母と呼ぶことにします）のコロニーは肉眼でも蛍光緑に見えます。培養液も緑…
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Research Gateという研究者のコミュニティーサイト・データベースがあり、私も登録しています。 Research Gateからは、論文の引用があったりするとメールで知らせてくれるのですが、先日、「Congratu…
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